溫室大棚是一個半封閉的空間，里面不受雨水的淋溶作用，棚內溫度較外面溫度高，蒸發旺盛，地表容易積鹽，而且復種指數高，土壤容易殘留根系分泌物。室內空氣濕度高，易發生病蟲害，所以溫室內土壤環境極為重要。

1.科學配方施肥

過量施肥會導致土壤次生鹽堿化，所以在施肥前根據作物需肥情況，進行科學配方施肥，減少肥料浪費，也是防止土壤次生鹽堿化的一個有效方法。

2.合理灌溉

改進灌溉方式，進行合理灌溉，可以有效降低土壤水分蒸發量。采用滴灌、滲灌等節水灌溉方式可以有效防止土壤下層鹽分向表層集聚。

3.換土、輪作和無土栽培

換土工程量大，一般不會用此法。采用合理的輪作措施可以有效避免土壤連作障礙，但是溫室大棚內栽培作物復種指數高，所以輪作措施有些情況下可以用。土壤栽培果蔬，是解決土壤連作障礙最徹底的途徑。

4.土壤消毒

溫室內高溫高濕的環境，為病蟲害滋生創造了適宜環境，土壤中存在一些病原菌和微生物，所以可以采取對土壤消毒的方式來殺毒，可以用氯化苦等化學藥劑進行消毒，也可用高溫悶棚處理等物理方式來消毒。

通過改善土壤微環境，為植物生長創造良好的生長條件。無土栽培可有效避免土壤種植發生的一些問題。